Im Mittelpunkt der Ausstellungen steht der Lehrer der Nationen J. A. Komenský, der die Brüderschule in Přerov besuchte und später dort unterrichtete; man erinnert darüberhinaus an den hiesigen
Landsmann Jan Blahoslav, einen bedeutenden Sprachwissenschaftler und Übersetzer. Sehr wertvoll ist die Sammlung der in der Region Přerov zu Tage geförderten archäologischen Funde. In einem an das
Museum angeschlossene Institut betreibt man auch Forschungen auf dem Gebiet der Geschichte des Schulwesens, der Komeniologie und der Regionalgeschichte. Weiterhin finden in dem Museum auch eine
ornitologische Station, die Verwaltung der Burg Helfštýn und die Schlossverwaltung ihren Platz.